早期的吉林大学和辽宁大学都是综合性高校，都是以文理为主的学校。差异在于吉林大学法学、数学等当时都比较突出，而辽宁大学的经济学方面实力较强。但是两所学校的实力差距还是比较明显的，主要是因为吉林大学是我党建国后独立创建的第一所综合性大学，身体特殊，位置重要，标志性高校。
辽宁大学和吉林大学虽然都位于东北地区，而且都以各自的省名为学校名，但是两所学校在各自省内来讲排名绝不相同。辽宁大学在辽宁省内一般在四五名左右，前面占有绝对优势的高校是大连理工大学和东北大学；而吉林大学始终是吉林省内排名第一的高校，是真正名副其实的“吉林”大学。这种在各自省内排名差距就已经说明两所学校的实力差距之大了。
吉林大学早期发展较快，而且建立成体系的教育模式，但是进入新世纪之后，因合并众多高校，而且积极改造和扩建，使得其负债较高，学校发展也跟着进入低谷徘徊了一阵子，好在政府帮忙解决债务问题，吉林大学有得以焕发清楚，近些年办学成绩显著。如涉及长白山的中草药育种，以松辽为主的页岩油，地球物理探测，集成光电，汽车仿真，无机合成等方面都有重大成果。
辽宁大学以经济学为老本，这方面的实力确实很强，尤其是政治经济学方面实力较为突出。其他工科方面实力都很一般，只是比普通本科高一些而已，还无法同知名大学相提并论。相对吉林大学来讲确实可圈可点的地方少了很多。吉林大学合并了多所高校，规模扩大了很多，学科也相对更为全面，综合性实力相当高，而且理工学科近些年也频频出成绩，真不是简单的“巨无霸”大学了。这些都是辽宁大学无法比的地方，两所学校差距真心太远！